Das Referat Finanzen ist für die Verwaltung der Finanzmittel und das Rechnungswesen der Hochschule zuständig. Dies umfasst neben der Verbuchung von Ein- und Ausgangsrechnungen auch die Abrechnung von Dienstreisen, die Anlagenbuchhaltung sowie die Bearbeitung steuerrechtlicher Fragestellungen. Zudem obliegt dem Referat Finanzen die administrative Abwicklung aller Drittmittelprojekte – von der Antragstellung bis zur finalen Abrechnung.